先抛结论：啥问题没有。
晚睡晚起和熬夜是两种不同的概念。
熬夜的标准在于：睡眠少于八小时，作息时间不规律。
而像题主这样长期晚睡晚起，既保证了睡眠时间，又保证了规律，你就是换个时差睡觉而已。
不过，3点睡觉11点起床会遇到一些问题，只要妥善处理好就没问题。比如，要做好隔音，因为外面可能有车流人等等嘈杂的声音（住闹中取静的小区或郊区当我没说）；还有就是做好挡光工作，11点起床，特别是夏天，外面亮度高，保证睡眠环境昏暗才能保证睡眠质量。
不知有没有科学道理，从我自身经历来看，早睡早起比晚睡晚起精神更好，白天的可利用时间更多。
个人感觉没什么区别，近几个月几乎天天1点睡9点起，中午午睡半个小时，但最好还是作息规律一些吧
